Воспитанник столичной команды «Прогресул» (также известной как «Национал»). За свою карьеру провёл большинство матчей именно в этой команде (173 игры, 19 голов). В 1990-е годы также выступал за «Пандурий» и столичное «Динамо». В 2000 году переехал в Бельгию и стал игроком «Стандарда», в его составе провёл 47 игр. Почти столько же (46 матчей) он провёл в «Монсе». Один год отыграл в «Антверпене», но не закрепился в составе и вернулся в столичное «Динамо», где и завершил карьеру.
В сборной
Вызывался в сборную с 1997 по 2001 год. Провёл 32 игры и трижды забивал голы. В составе команды выходил в плей-офф чемпионата мира 1998 года и чемпионата Европы 2000. На чемпионате мира играл под 13-м номером, на Евро-2000 под номером 3. После невыхода Румынии на ЧМ-2002 перестал вызываться в сборную.
Тренерская
Перепробовал свои силы в разных клубах Румынии из разных лиг, в том числе «Прогресула» и «Пандурия».
Интересные факты
Как и вся сборная Румынии, на матчах чемпионата мира 1998 года Чоботариу красил волосы в жёлтый цвет, что обычно приносило удачу румынской команде.