26 мая 1943 года она получила задачу разгромить артиллерийские и миномётные позиции противника в районе станицы Киевской.
«Наша группа была встречена сильным огнём зенитной артиллерии противника. Несмотря на мощный заслон заградительного огня, самолёты упорно шли к цели. Вдруг „Петляков“ резко тряхнуло. Он опустил нос и начал переходить в пикирование. Но Надя быстро восстановила его на прежней высоте. Штурман взглянула на неё и увидела, что из-под шлема по её лицу струйкой течёт кровь… „Ранена в голову!“ — мелькнула тревожная мысль. До цели оставались считанные секунды полёта. Видя беспокойство штурмана, Надя сказала: „Ничего, потерплю! Целься точнее!“ Вот сброшены бомбы, на земле возникли пожары, замолчала вражеская батарея. Превозмогая боль, Федутенко строго выдержала боевой курс. В этом полёте она была заместителем ведущего группы и, несмотря на ранение, продолжала держаться в строю, готовая каждую минуту заменить ведущего. Хладнокровно и уверенно посадила она самолёт, доложила о выполнении задания, и только после этого её увезли в госпиталь».
За точный и эффективный удар, который обеспечил наступление нашей пехоты, группа ещё в воздухе услышала благодарность командующего наземной армией.
Приказом № 22/н от 4 июня 1943 года по 2-му бомбардировочному корпусу (2 бак) награждена орденом Отечественной войны I степени.
7 июля 1943 года награждена медалью «За оборону Сталинграда». С 10 июля 1943 года на Западном фронте.
2 сентября 1943 года Н. Н. Федутенко выполняла боевое задание в составе большой группы самолётов, обеспечивающей прорыв укреплённой полосы противника в районе города Ельни. Над целью группа была обстреляна сильным огнём зенитной артиллерии и атакована истребителями противника. Зенитным огнём был сбит ведущий колонны. Став на его место, Н. Н. Федутенко вывела всю группу — 54 самолёта — точно на цель.
Приказом по ВВС № 49 от 5 сентября 1943 года капитан Федутенко награждена орденом Красного Знамени за 11 боевых вылета с момента выхода из госпиталя и выполнение ответственного боевого задания.
Она первой в полку превысила расчётные возможности самолёта, увеличив его бомбовую нагрузку до 1200 килограммов. Летом 1944 года начались бои в районе Орши, Витебска и Борисова. Это были напряжённые дни, когда Федутенко вылетала на задания по 2-3 раза.
Приказом по ВС 1-й ВА № 32/н от 10 июля 1944 года гвардии капитан Федутенко награждена вторым орденом Красного Знамени за 33 боевых вылета и уничтожение полотна железной дороги на участке Орша-Смоленск, а также миномётных и артиллерийских батарей противника в районе посёлка Центральный.
К декабрю 1944 года командир авиационной эскадрильи 125-го гвардейского бомбардировочного авиационного полка (4-я гвардейская бомбардировочная авиационная дивизия, 1-й гвардейский бомбардировочный авиационный корпус, 3-я воздушная армия, 1-й Прибалтийский фронт) гвардии майор Н. Н. Федутенко выполнила 56 боевых вылетов на самолёте «Пе-2» на бомбардировку скоплений живой силы и техники противника, нанеся ему значительные потери.
С 8 февраля 1945 года на 2-м Прибалтийском фронте. 14 марта 1945 года была представлена командиром 125-го ГБАП гвардии подполковником Марковым к званию Героя Советского Союза.
Фрагмент из представления на звание Героя:
«На самолёте Р-5 эвакуировала из окружения около 150 бойцов и командиров. Выполнила 56 боевых вылетов на самолёте Пе-2. Сбросила 50,4 т бомб. 15 декабря1944 года в качестве ведущей эскадрильи в составе девяти Пе-2 нанесла бомбардировочный удар по порту Либава. Лично сама и в составе групп нанесла противнику значительные потери в живой силе и боевой технике. Взорвала 3 склада с боеприпасами, 3 железнодорожных эшелона, уничтожила 5 пулемётных точек, до 30 машин и 12 танков».
Если позволяли условия, Надежда Федутенко совершала посадку, чтобы забрать раненых, получить важные разведданные:
К концу войны гвардии майор Н. Н. Федутенко совершила 220 успешных боевых вылетов. 18 августа 1945 года за мужество и воинскую доблесть, проявленные в боях с врагами, удостоена звания Героя Советского Союза.
Указом Президиума Верховного Совета СССР от 18 августа1945 года за успешное командование эскадрильей, образцовое выполнение боевых заданий командования и проявленные мужество и героизм в боях с немецко-фашистскими захватчиками гвардии майору Надежде Никифоровне Федутенко присвоено звание Героя Советского Союза с вручением ордена Ленина и медали «Золотая Звезда» (№ 7930).
Ольховская-Кострикина Г.Командир гвардейской эскадрильи // Героини: очерки о женщинах — Героях Советского Союза / ред.-сост. Л. Ф. Торопов; предисл. Е. Кононенко. — Вып. 2. — М.: Политиздат, 1969. — 463 с.
Федутенко Надежда Никифоровна // Герои Советского Союза: Краткий биографический словарь / Пред. ред. коллегии И. Н. Шкадов. — М.: Воениздат, 1988. — Т. 2 /Любов — Ящук/. — С. 647. — 863 с. — 100 000 экз. — ISBN 5-203-00536-2.