В 17 лет пошёл по стопам отца, начав заниматься тяжёлой атлетикой[5]. Участвовал в чемпионате начинающих тяжелоатлетов в феврале 1949 года, а спустя месяц — в юношеском чемпионате[7]. Стал чемпионом Чехословакии среди юношей с результатом 285 килограммам[4]. На соревнованиях получил травму межпозвоночного диска из-за чего врачи запретили ему заниматься тяжёлой атлетикой[7].
После выздоровление он продолжил заниматься спортом в рамках лёгкой атлетики. Вначале обратил внимание на метание молота, но в итоге остановился на толкании ядра. Через восемь месяцев тренировок он дебютировал на чемпионате Чехословакии, где занял девятое место. Продолжив тренировки он бросил ядро на 15 метров на чемпионате Праги. Свою первую победу на чемпионате Чехословакии Иржи одержал в 1951 году[7]. Первоначально тренировался под руководством Отакары Яндеры[чеш.][4], а впоследствии его тренером стал Ото Водичка из клуба «Спарта». Позднее Скобла перешёл в клуб «Дукла»[5].
В общей сложности он шесть раз побеждал на чемпионате Чехословакии, имея в своём активе национальный рекорд в виде 18,50 метра 1963 года. Окончательно он завершил карьеру в 1966 году, после чемпионата Европы в помещении, где Иржи Скобла занял третье место[7].
Впоследствии он стал тренером. Работал в клубе «Дукла». Тренировал таких метателей метателей ядра как Ярд Брабец, Яромир Влк[англ.], Франтишек Жемба, Гонзу Скупе и Зденек Дворжак, а также метателей молота — Ярда Харвата, Петра Горака, Станда Плугаржа и Радомила Скумаля. Состоял в коммунистической партии[5]. Свободно владел русским языком[11]. В 1970-е годы являлся членом Центрального комитета Чехословацкого общества физической культуры. Входил в спортивный комитет Федерации легкой атлетики Чехословакии, где курировал толкание ядра[7].
Участвовал в чемпионате мира среди ветеранов в 1977 году, где занял первое место с результатом 15,43 метра[5].
Скончался 18 ноября 1978 года в Праге[5]. По словам Михала Полака из Антидопингового комитета Чехии причиной смерти Скоблы стало употребление анаболиков[12]. Его урна с прахом хранится в крематории Страшнице[чеш.][13].