С 1996 по 1999 годы — в самостоятельной творческой деятельности. С 1999 года преподавал в Российской академии живописи, ваяния и зодчества на кафедре композиции.
В 2002 году он получил учёное званиедоцента, окончив аспирантуру Российской академии живописи, ваяния и зодчества по творческой специальности «живопись» (кафедра живописи и рисунка).
По окончании академии остался преподавать и работал последовательно на кафедре архитектуры, реставрации и композиции до 2007 года.
В 2014 году Павел Рыженко отдал все свои работы в дар Российской Федерации. Картины было решено разместить в музее-усадьбе «Полотняный Завод», бывшей усадьбе Гончаровых в Полотняном Заводе.
В 2014 году выпущен набор почтовых марок номиналом 15 рублей "Современное русское искусство", включающий марку с изображением картины П.В. Рыженко "Победа Пересвета", написанной им в 2005 году.[6]
В июле 2015 года на территории мужского монастыря Тихонова пустынь в селе Дворцы во Владимирском скиту, где расположен музей-диорама «Стояние на Угре», был установлен бюст художника. Он был изготовлен в Студии военных художников им. М. Б. Грекова[8].
В 2018 году общеобразовательной школе №28 города Калуги, в которой учился П. В. Рыженко, присвоено его имя и установлена мемориальная табличка.[9]
Павел Рыженко. Империя в последней войне. Каталог персональной выставки. Российское военно-исторические общество. 16 ноября 2014. 46 с. Илл. [сост. А.Ю. Рыженко].