Заповедные территории Молдавии включают следующие категории^[1]:

• Научные заповедники: 5 заповедников площадью более 19 тысяч гектар. Они эквивалентны IUCN категории Ia (строгий природный резерват).
• Национальные парки: существует национальный парк Орхей, созданный в 2013 году^[2].
• Памятники природы
• Природные заповедники
• Ландшафтные заказники
• Ресурсные резервы
• Области с многофункциональным управлением
• Водно-болотные угодья международного значения
• Дендрологические сады
• Достопримечательности ландшафтной архитектуры
• Зоологический сад в Кишинёве

Название		Площадь	Основан	Фото	Ссылка
1	Национальный парк Оргеев	33 792,09 га	2013		facebook.com/ParculNationalOrhei/

Название		Основан	Площадь	Фото
1	Кодры	1971	5177 га
2	Ягорлык	1988	836 га
3	Прутул-де-Жос	1991	1691 га
4	Плаюл-Фагулуй	1992	5642 га
5	Пэдуря-Домняскэ	1993	6032 га

Концепция создания национальной экологической сети была заложена в 1991 году (Комплексная территориальная схема охраны природы в Республике Молдова) и включает следующие основные элементы: 1. природные территории, репрезентативные для структуры биосферы (ядро); 2. экологические коридоры миграции и распространения; 3. реорганизованная "экологическая ткань" (агроценозы); 4. буферные зоны.

Элементами ядра по сути являются природные территории, охраняемые государством, компактные репрезентативные и обладающие высоким жизнедеятельным потенциалом участки природных лесных, степных, пойменных и водно-болотных экосистем.

В обеспечении стабильности всех элементов национальной экологической сети важная роль принадлежит "экологическим тканям" для дополнения агроценозов, предполагающим повышение гетерогенности сельскохозяйственных ландшафтов (путем включения в их состав различных типов биоценотических оазисов), а также создание сети лесных полос, обеспечивающих как взаимосвязь природных экосистем, так и охрану агрофитоценозов.

Компонентами национальной экологической сети, имеющими глобальное значение, являются водно-болотные угодья: зоны разлива Прута в дельте Дуная (биосферный заповедник "Делта Дунэрий") и зона впадения Днестра в Черное море (биосферный заповедник "Ниструл Инфериор"), служащие местообитанием многих видов птиц, совершающих перелеты по направлениям юг-север и восток-запад.

Общеевропейское значение имеют плавни в верхнем и среднем течении Днестра и Прута, научные заповедники Кодры, Плаюл Фагулуй, Пэдуря Домняскэ, Прутул де Жос, Ягорлык. Национальное значение имеют плавни в поймах рек Рэут, Бык, Ботна и других притоков Днестра и Прута, природные заповедники и репрезентативные ландшафтные участки, озера и большие водохранилища, рекреационные зоны, лесозащитные полосы и биоценотические оазисы в сельскохозяйственных экосистемах.

В степных зонах (Бэлць и Буджак) сохранились очень незначительные островки природной растительности и большинство территорий включено в сельскохозяйственный оборот. В зоне среднего и нижнего течения Днестра и Прута природные экосистемы сохранились, но их функциональность значительно нарушена. В зоне Центральных Кодр и в северной зоне страны доля природных экосистем удовлетворительна и их функциональность относительно оптимальна. Особого внимания требуют ареалы растительных сообществ и ценных местообитаний фауны в плане их восстановления, охраны и организации мониторинга на национальном, региональном и международном уровнях. Основные местообитания видов растений и животных, находящихся под угрозой исчезновения, находятся в научных заповедниках Кодры, Плаюл Фагулуй, Пэдуря Домняскэ, Прутул де Жос, Ягорлык, в лесном массиве "Орхей", в поймах рек и в озерах в среднем и нижнем течении Днестра и Прута.

Анализ распределения и сосредоточения редких видов и флористико-фаунистических комплексов на территории страны, оценка значения путей миграции животных и распространения растений позволили выявить следующие приоритетные зоны сохранения биоразнообразия: Центральные Кодры, Нижний Прут с дельтой Дуная, Средний Прут, Нижний Днестр с северо-западной частью бассейна Черного моря, Средний Днестр. ^[3]

• Coca, Mihail (2006), "Rezervațiile științifice în Republica Moldova: între mit și realitate" (PDF), Mediul Ambiant (4 (28)): 29-30, Архивировано (PDF) 8 июля 2020, Дата обращения: 8 июля 2020
• Медиафайлы по теме Природоохранные зоны Молдавии на Викискладе
• Путеводитель «Природоохранные зоны Молдавии» в Викигиде (рус.)

• Postolache, Gheorghe (august 2003), "Ariile protejate", Mediul Ambiant (4 (9)): 12-14 {{citation}}: Проверьте значение даты: |date= (справка)
• Mustea, Mihai (aprilie 2004), "Regimul de pază și protecție în ariile protejate", Mediul Ambiant (2 (13)): 31-32 {{citation}}: Проверьте значение даты: |date= (справка)