21 октября 2022 года президент Украины Владимир Зеленский назначил Сергея Попко начальником Киевской городской военной администрации[5].
31 декабря 2024 года указом президента Украины, генерал-полковник Сергей Попко уволен с должности начальника Киевской городской военной администрации[6].
Орден Богдана Хмельницкого II ст. (24 августа 2013) — за весомый личный вклад в защиту государственного суверенитета, обеспечение конституционных прав и свобод граждан, укрепление экономической безопасности государства, высокопрофессиональное исполнение служебных обязанностей и по случаю 22-й годовщины независимости Украины[9].
Медаль «За военную службу Украине» (19 августа 1998) — за образцовое выполнение воинского долга, достижение высоких показателей в боевой и профессиональной подготовке и по случаю 7-й годовщины независимости Украины[11].