В 1953 году основал камерный ансамбль «Жан Мари Леклер» (по имени известного французского композитора), в 1959 году преобразованный в Камерный оркестр Жана Франсуа Пайяра (фр.Orchestre de chambre Jean-François Paillard). С этим коллективом Пайяр широко гастролировал по всему миру и осуществил сотни аудиозаписей, специализируясь преимущественно на инструментальной музыке эпохи барокко. При этом он придерживался академической её интерпретации и не разделял радикальных взглядов аутентистов (строй, «исторические» инструменты, внедрение контратеноров и детских дискантов, и т. п.) до конца жизни.
В 1960 году Пайяр опубликовал обзорный очерк «Французская классическая музыка» (фр.La musique française classique), посвящённый преимущественно эпохе барокко. В июне 1968 г. его оркестр записал практически неизвестный дотоле канон нюрнбергского композитора Пахельбеля с облигато за авторством самого Пайяра; эта запись возглавила многие хит-парады классической музыки и доставила канону всемирную известность[2].
В 1952—1978 гг. был женат на клавесинистке Анн-Мари Бекенстейнер, игравшей в составе его оркестра. Отец трёх сыновей.
Литература
Le miracle Erato: par les plus grands musiciens français de l’histoire <…>, ed. Thierry Merle. Paris, 2004. ISBN 2952141304.