Первый раз захватил власть в 1484 году, отняв у брата Ильхама, однако не смог её удержать, второй раз, при помощи русских войск, взявших Казань, сел на престол в 1487 году.
В период изгнания с Казанского престола (1496—1502) временно получил в правление от московских правителей Хатунь и Каширу. Участвовал в войне с Литвой в 1500 году. На юге вместе с Василием Шемячичем и Семеном Стародубским, бывших в московском войске Якова Захарьича, действовали его вспомогательные отряды с великокняжескими воеводами братьями Иваном и Федором Палецкими.[3]
Переписываясь с Иваном III, называл себя его братом, однако на деле был целиком подчинён великому князю московскому[источник не указан 1097 дней]. Лишь в последний год жизни Ивана III вышел из-под контроля. Избиение русских купцов на казанской ярмарке в 1505 году ознаменовало начало русско-казанской войны 1505—1507 годов. Мухаммед-Амин в том же году без успеха пытался осадить Нижний Новгород. В 1507 году был заключён мир[4]. В 1510—1511 годах при посредничестве ханши Нур-Султан и её пасынка Сахиб-Гирея (будущего крымского хана) заключил новый договор с Василием III, признав его верховенство.
Мухаммед-Амин не оставил после себя сыновей. С его смертью на казанском престоле пресеклась династия Улу-Мухаммеда.
