Музей состоит из двух залов: археологическая секция с постоянными экспонатами по израильской археологии, жизни финикийцев и древних ремесел. В художественной секции экспонируются произведения искусства XIX века, в особенности импрессионизм и др[3].
Экспонаты музея отображают археологию и историю Земли Израиля в хронологической последовательности,[5] от медного века до византийского периода.
Экспонаты включают монеты, гири, семитские печати, украшения, артефакты из раскопок Храмовой горы; предметы, относящиеся к финикийской металлообработке, деревообработке, каменным сосудам, стеклоделию и мозаики.
В музее также находится корабль "Мааган Майкл " — обломки торгового судна V века до нашей эры. Художественная коллекция музея включает французскую живопись Барбизонской школы, импрессионизма, постимпрессионизма и Парижской школы, а также еврейское искусство середины XIX и начала XX века.
В музее есть акустический зал на 380 мест[7] и орган, построенный Гидеоном Шамиром из частей органов, использовавшихся в церквях по всей стране более века назад. Он также служит учебным центром для студентов и ученых-исследователей, предлагая дополнительные исследования в области археологии, искусства, Библии и истории для школьников, солдат, учителей и широкой общественности.
Музей проводит ежегодный художественный конкурс для старшеклассников, солдат и студентов, изучающих изобразительное искусство. Победители конкурса получают стипендии от Hecht Foundation, который также присуждает стипендии магистрам и докторам наук, студентам факультетов археологии и морской археологии .
Музей проводит научные конференции, симпозиумы, семинары и лекции, издает каталоги своих археологических и художественных выставок.
Журнал
Институция издает «Михманим» — музейный журнал, который публикует научные статьи об археологических исследованиях и артефактах из музейной коллекции.