Маргарита была третьей, младшей дочерью и седьмым ребёнком Генриха II и Екатерины Медичи. Французский престол по очереди занимали её братья Франциск II (1559—1560), Карл IX (1560—1574) и Генрих III (1574—1589).
С малолетства девочка отличалась очарованием, независимым нравом и острым умом, и в духе эпохи Ренессанса получила хорошее образование: знала латынь, древнегреческий, итальянский, испанский языки, изучала философию и литературу, хорошо владела пером. Среди ее учителей был гуманист Жак Амио, епископ Оксеррский. «Королева Марго» — литературное изобретение писателя Александра Дюма, растиражированное в последующее время. Именем «Марго» её называл только Карл IX.
Матримониальные планы
С раннего детства рука Маргариты была предметом торга: сначала её прочили в невесты Генриху де Бурбону, принцу Беарнскому и наследнику королевства Наварра, затем — дону Карлосу, сыну Филиппа II Испанского. Самые долгие переговоры (1560—1571) о замужестве длились с португальским двором и королем Себастьяном, однако брак не состоялся, главным образом, из-за противодействия испанской короны. В 1570 году у Маргариты завязались романтические отношения с герцогом Генрихом де Гизом — фактическим главой католиков Франции и позднее претендентом на трон, что побудило Карла IX и Екатерину Медичи изолировать принцессу, поскольку возможный брачный союз усилил бы позиции семьи Гизов и нарушил хрупкий баланс между католиками и протестантами. Для обеспечения выполнения условий Сен-Жерменского мира с гугенотами в 1571 г. Карл IX и Екатерина Медичи возобновили переговоры о браке Маргариты с принцем Наваррским. Итоговые пункты брачного соглашения подписала королева-мать и Жанна д’Альбре, мать Генриха.
Королева Наваррская
18 августа 1572 года девятнадцатилетняя католичка Маргарита была выдана замуж за своего ровесника, гугенота Генриха де Бурбона, короля Наваррского, принца крови и троюродного брата. Венчание происходило в Соборе Парижской Богоматери по специально разработанному церемониалу, когда ее мужа на алтаре представлял ее брат Генрих Анжуйский. Свадьба, отпразднованная с большой пышностью и собравшая в Париже цвет гугенотской знати, закончилась Варфоломеевской ночью, массовым избиением протестантов в ночь на 24 августа 1572 г. Уцелев во время резни в Лувре и сохранив хладнокровие, Маргарита спасла жизни нескольким гугенотским дворянам и главное, своему мужу, Генриху Наваррскому, отказавшись оформлять развод с ним, как настаивали её родственники.
Когда Генрих Наваррский бежал из Парижа в 1576 году, она какое-то время ещё оставалась при дворе в качестве заложницы, поскольку Генрих III небезосновательно подозревал, что она была причастна к интригам мужа. В 1577 году ей позволили совершить дипломатическую поездку в испанскую Фландрию, охваченную освободительным движением, с целью подготовить почву для занятия трона герцога Брабантского её младшим братом, Франсуа Алансонским. Проведя достаточно успешные переговоры с фламандской знатью, настроенной профранцузски, она смогла ускользнуть от преследовавших ее отрядов дона Хуана Австрийского, испанского губернатора Нидерландов. Маргарита отправилась к своему мужу только летом 1578 г., когда был заключён промежуточный мир с гугенотами, и до начала 1582 года жила в его резиденции в Неракском замке, собрав вокруг себя блестящий двор.
По настоянию Генриха III она вернулась в Париж, в надежде, что муж последует за ней, но в августе 1583 г. рассорилась с королем и матерью, поскольку открыто противостояла королевским фаворитам — герцогам д’Эпернону и Жуайезу, и интриговала в пользу своего младшего брата. После этого Маргарита покинула французский двор и направилась назад в Нерак, но там оказалась в политической изоляции, поскольку Генрих Наваррский постоянно пребывал подле своей фаворитки графини де Гиш.
Начиная с лета 1584 г., после смерти Франсуа Алансонского, король Наваррский — законный наследник французской короны, что позволяло ему уже не использовать посредничество жены в своих отношениях с французским двором, а действовать самостоятельно, диктуя условия бездетному Генриху III. В такой ситуации в мае 1585 г. Маргарита отправилась в Ажен, своё собственное католическое графство на юге Франции, где объявила себя членом Католической Лиги, возобновила отношения с герцогом де Гизом и фактически выступила против мужа и брата. Осенью 1586 г., после провала аженской авантюры, она была взята под стражу отрядами Генриха III и отправлена в замок Юссон в Оверни, но в качестве узницы пробыла около двух месяцев. Герцог де Гиз выкупил её у коменданта и сделал хозяйкой замка. Швейцарцы, её охранявшие, присягнули ей на верность. Гиз погиб в 1588 г., Генрих III — в следующем году, а Генрих Наваррский с военным лагерем перемещался по всей Франции, давая сражения лигерам и иностранным интервентам. В Париже расположился испанский гарнизон, поддерживавший претензии испанской инфанты на французский трон. В такой ситуации Маргарите некуда было возвращаться.
В Юссоне она прожила последующие 18 лет, до 1605 г. После вступления на престол Генриха IV папа Климент VIIIрасторг его бездетный брак с Маргаритой (30 декабря 1599 г.).
Последние годы
Последние годы жизни Маргарита провела в Париже, собрав вокруг себя самых блестящих учёных и писателей. Она оставила мемуары (Париж, 1628); собрание её писем издал Guessard (Париж, 1842) и Элиан Вьенно (Париж, 1999 и переиздания).
Маргарита де Валуа не изменила себе и в конце жизни. Окружённая поклонниками, часто много младше её, она продолжала быть участницей светских авантюр, равно как и важных политических событий. Даже после развода с Генрихом IV она осталась членом королевской семьи с титулом королевы, и как последняя Валуа воспринималась в качестве единственной легитимной наследницы королевского дома. Король постоянно привлекал её для организации больших церемониальных мероприятий в духе двора Валуа и поддерживал с ней тесные отношения. Его вторая жена, Мария Медичи, часто просила её совета. После убийства Генриха IV в 1610 году Маргарита много усилий приложила для того, чтобы гражданские смуты не разгорелись с новой силой.
27 марта 1615 года она умерла от воспаления лёгких, завещав всё своё состояние королю Людовику XIII, которого любила как своего родного ребёнка.
2017 — Чёрная легенда о королеве Марго / La légende noire de la Reine Margot (реж. Филипп Вержо / Philippe Vergeot) — документально-игровой — в роли королевы Марго — Эльза де Белиловски / Elsa de Belilovsky
2024 (2 сезон) — Королева змей / The Serpent Queen — в роли королевы Марго — Филиппина Вельж
Маргарита де Валуа. Мемуары. Избранные письма. Документы / Издание подготовили В. В. Шишкин, Э.Вьенно и Л.Ангар. — СПб: Евразия, 2010 (переиздания 2017 и 2019).