Футбольный клуб «Копенгаген» был образован 1 июля 1992 года в результате слияния двух клубов: «Копенгаген Больклуб», старейшего футбольного клуба в континентальной Европе, основанного в 1876 году, и «Больклуб 1903», основанного в 1903 году.
Команда под руководством Бени Йохансена одержала свою первую победу на международной арене в матче Кубка Интертото, победив швейцарский «Грассхопер» со счётом 2:1. Заняв первое место в своей группе, клуб получил право играть в Кубке УЕФА, но проиграл в противостоянии французскому «Осеру». В сезоне 1992/93 «Копенгаген» победил в дебютном для себя чемпионате Дании, на одно очко опередив «Оденсе» и на два — «Брондбю». В сезоне 1993/94 клуб не смог повторить успех, в решающем матче первенства проиграв «Оденсе» со счётом 3:2, довольствуясь в итоге вторым местом.