Площадь поверхности — 39,8 км²[4]. Площадь водосборного бассейна — 300 км²[1]. Высота над уровнем моря — 37 м[3]. Котловина тектонического происхождения[1].
Озеро представляет собой узкий водоём, вытянутый в направлении с северо-запада на юго-восток, разделённый цепью островов на две части: восточную и западную. Количество островов — 108, общая площадь островов — 6,2 км².
Средняя амплитуда колебаний уровня составляет 47 см[1].
Прибрежная зона сложена каменистыми грунтами, с глубины 4 м залегает вязкий зелёный ил, встречаются отложения железистой руды.
В озере обитает сиг, корюшка, щука, плотва, уклея, окунь, ёрш и налим. Реже встречаются лещ, хариус, форель (ручьевая и озёрная), язь и краснопёрка. Популярен зимний лов окуня на блесну.
Озеро служит приёмником коммунально-бытовых сточных вод посёлка Кончезеро[1].
История
На озере в 1897 г. Петербургским обществом естествоиспытателей по инициативе крупнейшего русского ученого-ботаника И. П. Бородина была открыта Бородинская станция. На её базе основана и работает Кончезерская биологическая станция (ныне в составе эколого-биологического факультета ПетрГУ). Задача станции — изучение озёр Северо-Запада России[8].
В 1960 г. силами Петрозаводской машинно-мелиоративной станции и Петрозаводского буровзрывного участка был устроен канал из Кончезера в Укшозеро. он был создан для понижения уровня воды в Кончезере для освоения плодородных земель для нужд совхоза "Кончезерский"[11].
↑Ресурсы поверхностных вод СССР: Гидрологическая изученность. Т. 2. Карелия и Северо-Запад / под ред. Е. Н. Таракановой. — Л.: Гидрометеоиздат, 1965. — 700 с.
↑Морозов, А. К. Кончезеро // Карелия: энциклопедия: в 3 т. / гл. ред. А. Ф. Титов. — Петрозаводск : ИД «ПетроПресс», 2011. — Т. 2: К — П. — С. 90. — 464 с. — ISBN 978-5-8430-0121-6.
Озёра Карелии (рус.) / Александров Б. М., Зыцарь Н. А., Новиков П. И., Покровский В. В., Правдин И. Ф.. — Петрозаводск: Госиздат Карельской АССР, 1959. — С. 252—269. — 618 с. — 3000 экз.