Несторас Комматос, уроженец города Лариса, начал игровую карьеру в местных молодёжных командах. Его первый профессиональный клуб также представлял Ларису, и в нём Комматос провёл три сезона, прежде чем подписать контракт с «Македоникосом».
После года в «Македоникосе» и двух лет в ПАОК Комматос оказался в составе «Ариса» — одного из ведущих клубов чемпионата Греции. В сезоне 2003/2004 годов он стал лучшим бомбардиром чемпионата Греции, набрав в среднем за игру 21,5 очка[2]. Он также стал обладателем Кубка Греции и был признан самым полезным игроком (MVP) матча всех звёзд чемпионата Греции[3]. В Евролиге ФИБА он дошёл с «Арисом» до четвертьфинала (где проиграл лидерам греческого чемпионата «Марусси» в трёх матчах[4]) и стал одним из пяти лучших бомбардиров турнира, набирая за 17 проведенных игр в среднем по 18,9 очка.
После успешного сезона в «Арисе» Комматос был приглашён в состав победителей Евролиги 2004 года«Маккаби» (Тель-Авив), с которым подписал контракт на один сезон на сумму в 450 тысяч долларов[5]. В составе «Маккаби» он за сезон завоевал все возможные титулы, став чемпионом Израиля, обладателем Кубка Израиля и победителем Евролиги. Тем не менее его личные показатели по сравнению с предыдущим годом резко упали, и по окончании сезона «Маккаби» уступил его итальянскому клубу «Климамио» (Болонья), с которым он подписал двухгодичный контракт на сумму 850 тысяч долларов за сезон[6]. Однако и в Больнье он не прижился и уже в январе 2006 года его отдали на остаток сезона в клуб испанской лиги«Каха Сан-Фернандо» (Севилья)[7]. Там он продержался всего два месяца, испортив отношения с командой и также не показав хорошей игры, и был освобождён уже в марте[8].
Следующий год Комматос провёл в греческом клубе АЕК, в 33 матчах лиги набирая в среднем по 13,1 очка за игру. Начав сезон 2007/2008 в составе команды российской Суперлиги «Локомотив-Ростов»[9], он, однако, после 19 игр, за которые набирал по 11,2 очка и 4,7 подбора, был отчислен в феврале по состоянию здоровья[10].
После кубанского клуба Комматос выступал два сезона за команды своей родной Ларисы, затем по полсезона в «Марусси», где набирал за игру в греческой Лиге А1 12,9 очка и 6,5 подбора[11], и в турецком «Мерсине». В сезоне 2011/2012 годов он опять выступал в составе двух разных клубов. Начав сезон в «Марусси», он занимал место во главе списка бомбардиров высшего дивизиона греческого баскетбола, набирая в среднем 20,4 очка за игру, в том числе 40 очков в матче с «Панатинаикосом» и 42 очка в матче с «Олимпиакосом». Несмотря на личные успехи Комматоса, клуб выступал крайне неудачно и в феврале форвард перешёл в итальянский клуб «Сант'Антимо», который благодаря его уверенной игре сумел избежать спуска лигой ниже[12]. В сезоне 2012/2013 годов Комматос вернулся в Грецию, где выступал за клубы «Ретимнон Критан Кингз», «Трикала», «Колоссос», с 2014 года играл за «Эрмис Агиас».
