Сын крестьянина Покровской слободы Новоузенского уезда Самарской губернии. Окончил 4-классное городское училище[2], по другим сведениям — земскую школу[3]. Служил конторщиком на станции Козлов Рязанской-Уральской железной дороги, позднее билетным кассиром. В 1902-1904 годах во время службы в Козлове принимал участие в работе подпольных народнических кружков[2]. После сдачи экзамена назначен помощником начальника станции Покровская Слобода. Там стал членом местной организации РСДРП, меньшевик, занимался пропагандой среди линейных служащих. В 1906 году арестован как член стачечного комитета забастовок 1905 года, по одним сведениям содержался 4 месяца в Саратовской тюрьме[2], по другим — пробыл в ней 2 месяца[3]. После этого служил писарем при земском начальнике в административном отделе[3].
7 февраля 1907 года избран в Государственную думу II созыва от съезда уполномоченных от волостей. Вошёл в состав Социал-демократической фракции. Был членом думской комиссии по местному управлению и самоуправлению[3].
По делу социал-демократической фракции 2-й Государственной Думы особым присутствием сената приговорён по 1 ч. 102 ст. Уголовного Уложения к ссылке на поселение, которую отбывал сначала в Богучанах, потом в Казачинском Енисейской губернии[2]. В октябре 1910 года сообщалось, что высылка Н. В. Комаря из села Казачинского приостановлена, он освобождён из тюрьмы с назначением на жительство в селе Казачинском "до особого распоряжения"[4]. Позднее отбывал ссылку в Минусинске Енисейской губернии и в Омске[2].
12 сентября 1938 года Николай Васильевич Комарь включён в "расстрельный список" по Саратову и Саратовской области "по 1-й категории"[5]. Расстрелян по приговору Выездной сессии ВКВС 27 октября 1938 г.
Курсивом выделены депутаты, избранные от города Самары; * — избран на место умершего С. О. Лаврова; ** — избран на место сложившего полномочия А. А. Ушакова.