В июле 1942 года весь полк был передан из ВВС РККА в состав ВВС Тихоокеанского флота ВМФ России, где получил наименование 52-й дальнебомбардировочный авиационный полк и включён во 2-ю минно-торпедную авиационную дивизию. Там сразу был назначен командиром эскадрильи, в августе 1943 — помощником командира 52-м дальне-бомбардировочного авиационного полка по лётной подготовке и воздушному бою. За отличную боевую подготовку эскадрильи и за выполнение задания по перегону группы самолётов на фронт в сложных метеоусловиях без происшествий в 1943 году награждён орденом Красной Звезды.[2]
В этой должности участвовал в советско-японской войне в августе 1945 года. Во главе крупных групп бомбардировщиков полка произвёл массированные налёты на бомбардировку военных объектов в военно-морской базе Сейсин (Чхонджин) в Северной Корее, на разрушение железнодорожных узлов и мостов на шоссейных дорогах, а также на борьбу с плавсредствами японцев. Совершил 5 боевых вылетов, особенно отличился при разрушении железнодорожного узла Киссю. Уничтожил много живой силы и техники противника. Полк выполнил 136 боевых вылетов без боевых потерь и без навигационных происшествий, в чем большая заслуга именно И. Т. Карпенко.[3]
В 1952 году окончил Высшую военную академию имени К. Е. Ворошилова. С января 1953 года — помощник командующего, с января 1958 года — заместитель командующего ВВС Черноморского флота. сам освоил несколько типов реактивных торпедоносцев и ракетоносцев, успешно организовал переобучение на них лётного состава.
Булкин С. П. Герои Отечества. — 2-е изд. — Донецк: Донбасc, 1977. — С.152—153.
Герои Советского Союза Военно-Морского Флота. 1937—1945. — М.: Воениздат, 1977. — С.212.
Герои Советского Союза: Краткий биографический словарь / Пред. ред. коллегии И. Н. Шкадов. — М.: Воениздат, 1987. — Т. 1 /Абаев — Любичев/. — 911 с. — 100 000 экз. — ISBN отс., Рег. № в РКП 87-95382.