Дебютировал в Кубке Мира на соревнованиях в финском Куусамо 27 ноября 2011 года, где занял 46 место. Первые очки в общий зачет завоевал 12 января 2013 года в родном Закопане показав двадцатый результат.
Первую победу на этапе Кубка Мира Ян Зёбро одержал 21 декабря 2013 года в Энгельберге, Швейцария, а также попутно установил рекорд трамплина, равный 141 метру. Второе место занял соотечественник Яна — Камил Стох. Спустя день Зёбро завоевал второй подиум в карьере — третье место. Впервые в истории польских прыжков два дня подряд на подиуме было два представителя страны. Хорошие результаты помогли молодому поляку зарекомендовать себя в главной команде.
В феврале 2014 года Ян участвовал в зимних Олимпийских играх в Сочи, где на нормальном трамплине показал 13-й результат, а на большом — 15-й. Вместе с командой остановился в шаге от пьедестала, заняв четвёртое место.
