Отто Вильгельм Зондер родился 13 июня1812 года в городе Ольдесло в Гольштейне в семье Иоганна Даниеля Зондера и Анны Эльзабы Катарины Треген. В 1828—1831 учился в Гамбурге аптекарскому делу, затем некоторое время практиковался в аптеке в южной Германии. После некоторого время учёбы в Берлине, в 1835 году прошёл государственную экзаменацию и стал аптекарем. Затем Зондер отправился в путешествие по Альпам и Средиземноморью. В 1841 году он приобрёл в Гамбурге аптеку Георга Аймбке. С 1852 года Зондер работал асессоров городского департамента здоровья.
Зондера более других групп растений интересовали растения тропиков и Южного полушария. В 1837 году он приобрёл гербарий Эклона и Цейгера из Южной Африки. Также Зондеру пересылал образцы растений из Австралии Фердинанд фон Мюллер. Зондер был одним из ведущих специалистов по южным водрослям.
Гербарий Зондера был одним из самых крупных частных гербариев XIX века. Впоследствии он был распродан по частям различным научным учреждениям. Наиболее важные части хранятся в Мельбурнских ботанических садах (MEL) и в Стокгольмском университете (S).
Некоторые научные публикации
Sonder, O.W. Revision der Heliophileen. — Hamburg, 1846. — 103 p.
Sonder, O.W. Flora hamburgensis. — Hamburg, 1850. — 601 p.
Sonder, O.W. Die Algen des tropischen Australiens. — Hamburg, 1871. — 74 p.
