15 июля1932 годаКонгрегация по делам епископов издала декрет Quo facilius, которой учредила Апостольская префектураапостольскую префектуру Горной провинции, выделив её из епархии Новой Сеговии (сегодня — архиепархия).
6 июля1992 года апостольский викариат Горной провинции передал часть своей территории для возведения апостольских викариатов Бонток-Лагаве и Табука и одновременно был переименован в апостольский викариат Багио.
24 июня2004 года Римский папа Иоанн Павел II выпустил буллу Diligenter adlaborare, которой преобразовал апостольский викариат Багио в епархию.