21 января 1945 года, когда противник атаковал советские позиции в районе города Побьяница, Докучаев со своим орудием преградил путь немецким танкам и уничтожил один из них, заставив остальные повернуть назад. В том бою он также уничтожил пять автомашин. На подступах к реке Варта он уничтожил ещё один вражеский танк[1].
Указом Президиума Верховного Совета СССР от 27 февраля 1945 года «за образцовое выполнение боевых заданий командования на фронте борьбы с немецкими захватчиками и проявленные при этом отвагу и геройство» гвардии сержанту Докучаеву Михаилу Степановичу присвоено звание Героя Советского Союза с вручением ордена Ленина и медали «Золотая Звезда» № 5669[2].
Участвовал в Параде Победы. После окончания войны Докучаев продолжил службу в Советской Армии. В 1951 году окончил Военный институт иностранных языков, после чего работал в спецслужбах СССР. В 1951—1953 годах Докучаев работал в Главном управлении специальной службы при ЦК ВКП(б)/КПСС, в 1953—1954 годах — в 8-м Управлении МВД СССР, в 1954—1956 годах — 8-м (шифровальном) Главном управлении КГБ СССР. В 1956 году Докучаев окончил Военно-дипломатическую академию, после чего служил в Первом главном управлении КГБ СССР. Занимался разведывательной деятельностью в Греции.
После возвращения в СССР занимал должности начальника направления (внутренняя безопасность) Службы № 2 (внешняя контрразведка) ПГУ КГБ при СМ СССР (1971-1972 годы) и начальника 5-го отдела (внутренняя безопасность) Управления «К» (внешняя контрразведка) ПГУ КГБ при СМ СССР (1972-1975 годы). С июля 1975 по май 1989 года - заместитель начальника 9-го Управления КГБ при СМ СССР
(с июля 1978 года - КГБ СССР). Отвечал за безопасность высоких советских руководителей, а также глав иностранных государств и правительств, прибывавших в СССР с официальными визитами.
За внедрение и освоение новейших образцов техники в 1986 г. удостоен звания лауреата Государственной премии СССР, а в 1999 г. стал академиком МАСИ — Международной Академии системных исследований при Московском Государственном химикотехнологическом университете им. Д.И. Менделеева.
В 1989 году в звании генерал-майора вышел в отставку.
Докучаев М. С. В бой шли эскадроны: Боевой путь 7-го гвардейского кавалерийского Бранденбургского ордена Ленина, Краснознаменного, ордена Суворова корпуса в Великой Отечественной войне. — М.: Воениздат, 1984. — 206 с. — 35 000 экз.
Докучаев М. С. Я охранял Брежнева и Горбачева. Откровения генерала КГБ. — М.: Алгоритм, 2016. — 256 с. — ISBN 978-5-906880-48-2.
Докучаев М. С. Москва, Кремль, Охрана. — М.: Бизнес-Пресс, 1995. — 240 с. — ISBN 5-7004-0004-9.
Докучаев М. С. История помнит. — М.: Собор, 1998. — 400 с. — ISBN 5-85588-019-2.
Герои Советского Союза: Краткий биографический словарь / Пред. ред. коллегии И. Н. Шкадов. — М.: Воениздат, 1987. — Т. 1 /Абаев — Любичев/. — 911 с. — 100 000 экз. — ISBN отс., Рег. № в РКП 87-95382.
Астраханцы — Герои Советского Союза. Астрахань 2000.
В созвездии славы. 2-е изд., доп. Волгоград, 1976.