Джонатан Стивенс Джексон родился в Орландо, Флорида, но вырос в Вашингтоне[2][3]. Родился в семье адвентистов седьмого дня. Когда Джексону было девять лет, родители отошли от этой организации[4]. В 2012 году принял православие вместе со своей семьёй[5].
В 1993 году Джексон получил роль Лаки Спенсера в мыльной опере «Главный госпиталь», которую он исполнял до 1999 года. Он выиграл три Дневные премии «Эмми» за свою работу в сериале: в 1995, 1998 и 1999 году[6]. Он вернулся в шоу в 2009 году и выиграл ещё две «Эмми» в 2011 и 2012 годах[6].
Женат на Лизе Валтаггио. Пара воспитывает троих детей: Калеба, Адору и Тайтуса[8].
В 2018 году Джонатан Джексон вместе с семьей впервые посетил Россию, совершил паломническую поездку, в которую входили посещение Москвы, Сергиева Посада, Санкт-Петербурга, Екатеринбурга, Нижнего Новгорода, Дивеева, Минеральных Вод, Буденновска, Пятигорска. В Санкт-Петербурге посещал могилу и музей Ф. М. Достоевского, а также встречался с потомками великого русского писателя. По словам Джонатана, один из главных факторов, повлиявших на его выбор в принятии православия, - это творчество Ф. М. Достоевского[9].
Кульминацией паломнической поездки явилось участие в ночной литургии в Храме на Крови в Екатеринбурге 17 июля, в день столетия со дня убийства царской семьи, где все члены семьи Джексонов причащались, а также посещение монастыря на Ганиной яме[9].