С 1942 года работал в редакции газеты «Коммунист». С 1945 по 1947 год Гюльгусейн Гусейноглу работал в редакции газеты «Адабиййат газети». Затем он перешёл в педагогический отдел Театра юного зрителя, где проработал два года — с 1947 по 1948. В 1947 году окочил Азербайджанский государственный университет. В 1948 году был обвинен в создании тайной организации "Илдырым", которая борется за независимость Азербайджана. Суд приговорил его к 25 лет тюремного заключния. В годы советской реабилитации в 1956 году был реабилитирован, а также восстановлен при аспирантуре Азербайджанского государственного университета.
Он уже в годы юности вел борьбу за независимость Азербайджана и был наказан за это. По возвращении из ссылки, Гюльгусейн муаллим начал свою литературную и научную деятельность. Я испытывал к нему большую симпатию. Я хотел, чтобы он написал обо всем, что с ним произошло в Сибири. Но судьба распорядилась по-своему. Да упокоит Аллах его душу![2]
«Полет орлов. Рассказы и стихи в прозе». - Сов. писатель, 1979.
Гюльгусейн Гусейноглу. Люди и волны : Рассказы, повести, сценарии / Гюльгусейн Гусейноглу; [Худож. А. Мамедов]. — Баку : Язычы, 1982. — 313 с. Тираж: 30 000[5]
Академик Абель Магеррамов на панихиде прощания сказал:
Сегодня мы прощаемся с нашим дорогим учителем. В истории азербайджанской интеллигенции он будет жить вечно. Его имя будет вписано в историю Бакинского Государственного университета золотыми буквами. Гюльгусейн Гусейноглу был очень интересным, чистым человеком, который жил для своего народа[2]
