Родилась в 1902 году в крестьянской семье в селе Лебединовка.
С 1937 года — рядовая колхозница, с 1946 года — звеньевая свекловодческого звена колхоза «Гигант» Ворошиловского района.
В 1947 году звено Аграфены Бочкарёвой собрало в среднем с каждого гектара по 692 центнера сахарной свеклы на участке площадью 7,65 гектаров и в 1948 году — в среднем по 857 центнеров сахарной свеклы с каждого гектара на участке площадью 3,5 гектаров. Указом Президиума Верховного Совета СССР от 16 мая 1949 года удостоена звания Героя Социалистического Труда с вручением Ордена Ленина и золотой медали Серп и Молот.
С 1968 года — персональный пенсионер союзного значения. Проживала в селе Аламудун (ныне — пригород Бишкека).
Скончалась в 1974 году.
Литература
Герои Социалистического Труда Киргизстана. — Фрунзе: Изд. «Кыргызстан», 1966.