19 февраля1992 года Постановлением Верховного Совета Белоруссии Бочаров был назначен начальником Главного управления Пограничных войск при Совете Министров Белоруссии — командующим пограничными войсками, став первым человеком, занявшим эту должность. Под его руководством формировались белорусские пограничные войска, он активно участвовал в разработке белорусского пограничного законодательства[1].
Был награждён двумя орденами Красного Знамени, орденами Красной Звезды, «За службу Родине в Вооружённых Силах СССР» 2-й и 3-й степеней, шестью афганскими орденами и рядом медалей. Посмертно зачислен Почётным пограничником[1].