С 1909 года занимал должность приват-доцента в Московском университете, а с 1927 года до конца жизни — профессора МГУ. Действительный чл. РАНИОН (1924)[6].
В 1910—1912 годах был членом Комитета прогрессивной группы гласных в Московской городской думе; секретарь Комитета в 1913—1917 годах. В 1913—1916 годах был земским гласным от Москвы.
В числе учеников Бахрушина в Московском университете был А. Н. Колмогоров, зачитавший на одном из семинаров свой доклад о новгородском землевладении, в котором применил методы математической статистики. Бахрушин одобрил доклад, но на вопрос ученика, нельзя ли ему опубликовать свою работу, преподаватель ответил: «Ну что Вы, молодой человек! Вы же нашли пока только одно доказательство. Для историка этого мало. Нужно, по меньшей мере, пять доказательств». Не исключено, что именно в тот момент, испытав разочарование, Колмогоров решил углубиться в математику, где достаточно одного доказательства[7].
Как участник «монархического заговора» Бахрушин был сослан в Семипалатинск (1931—1933) вместе с историком С. Ф. Платоновым (в рамках Академического дела[8]). В ссылке работал в библиотеке, преподавал в педагогическом и геологическом институтах Семипалатинска. В 1933 г. амнистирован и возвратился в Москву — на должность профессора Института красной профессуры[3].
Н. Ф. Демидова вспоминала: "Он шапочку такую носил не то академическую, не то просто тюбетейку, и он гордился, что татарского рода, подчёркивал это"[9].
Был редактором и соавтором коллективных трудов «История Москвы» (т. 1—2, 1952, 1953), «Очерки истории СССР» (1953), участвовал в написании «Истории дипломатии» (Сталинская премия, 1941), учебников по истории СССР для высшей школы.
Научные интересы
Круг научных интересов С. В. Бахрушина был чрезвычайно широк: от Киевской Руси до XIX в., от характеристик отдельных исторических личностей до широких полотен исторического развития России, от пропагандистских и популярных статей для массового читателя до фундаментальных академических исследований. Говоря о своих научных изысканиях, С. В. Бахрушин делил их тематику на четыре группы:
Малолетние нищие и бродяги в Москве: (Исторический очерк). — М.: Гор. тип., 1913. — 51 с.
Московский мятеж 1648 г. // Сб. статей в честь М. К. Любавского. П., 1917.
Очерки по истории колонизации Сибири в XVI и XVII вв. М., 1927.
Остяцкие и вогульские княжества в XVI—XVII веках. — Л.: Изд-во Ин-та народов Севера ЦИК СССР, 1935. — 91 с.
Завоевание Сибири: Стеногр. лекции проф. С. В. Бахрушина, прочит. 4 марта 1938 г.: [На правах рукописи]: [Только для слушателей и препод.]. — М.: Ин-т усовершенствования педагогов и руководящих работников комсельхозшкол, 1938. — 16 с.
Героическое прошлое славян. — М.: Воен. изд-во, 1941. — 14 с.
Дмитрий Донской. — Ташкент: Изд-во УзФАН, 1942. — 40 с. — ([Великие русские полководцы] / Акад. наук СССР, Узбекистан. филиал, Ин-т языка, лит. и истории)
Минин и Пожарский — Ташкент: Изд-во УзФАН, 1942. — 56 с. — ([Великие русские полководцы] / Акад. наук СССР, Узбекистан. филиал, Ин-т языка, лит. и истории)
Разгром Ливонского ордена в Прибалтике. (XVI в.). — Ташкент: Госиздат УзССР, 1942. — 32 с.
Сталинская премия I степени (10 апреля 1942) — за книгу «История дипломатии», т. I, опубликованную в 1941 году
Память
В честь С. В. Бахрушина названа гора в Антарктиде (Земля Королевы Мод, 71°27′ ю.ш., 12°28′ в.д., гора открыта и нанесена на карту в 1961 году, название присвоено в 1966 году)[11].
Дубровский А. М. С. В. Бахрушин и его время. М., 1992.
Зимин А. А. Творческий путь С. В. Бахрушина // Научные доклады высшей школы. Исторические науки. — 1961. — № 2.
Кафенгауз Б. Б. С. В. Бахрушин // Учёные записки МГУ. — 1952. — Вып. 156.
Каштанов С. М. Творческое наследие С. В. Бахрушина и его значение для советской исторической науки (К 100-летию со дня рождения) // История СССР. — 1982. — № 6.
Проблемы социально-экономической истории истории феодальной России. К 100-летию со дня рождения чл.-корр. АН СССР С. В. Бахрушина / отв. ред. А. А. Преображенский. М., 1984.
