Родился 19 января 1936 года в посёлке Морки ныне Марий Эл в семье редактора районной газеты И. Осокина и преподавателя Моркинского педагогического техникума Н. П. Бакулиной[1].
В 1950 году окончил Даниловскую 7-летнюю школу вблизи г. Йошкар-Олы[1].
В 1953 году окончил Саратовский геолого-разведочный техникум[1].
Работать начал в 1954 году в геологосъёмочной экспедиции Хабаровска старшим коллектором экспедиции[1][2].
С 1974 по 1983 годы возглавлял Дальневосточное территориальное геологическое управление. С момента реорганизации управления — генеральный директор ПГО «Дальгеология»[2].
В 1983—1986 годах стоял у истоков создания в Лаосе геологической службы: возглавлял группу советских геологов, вёл поиски полезных ископаемых, в результате чего были найдены золото и олово[2].
В 1986 году пришёл на работу, а затем и возглавил Дальневосточный НИИ минерального сырья — ДВИМС[3]. В 1987 году присуждена учёная степень доктора геолого-минералогических наук[2].
В 2000 году начал преподавать в высших учебных заведениях Хабаровского края. В 2008—2015 годах — профессор кафедры «Геология и землеустройство» ТОГУ — Тихоокеанского государственного университета[2].
В 1970 году защитил кандидатскую диссертацию на тему «Комплексирование геологических и геохимических методов поисков оловорудных месторождений в горно-таёжных условиях».
В 1987 году защитил докторскую диссертацию на тему «Золотоносные и оловоносные родные системы Дальнего Востока: (Типизация, прогнозирование, оценка перспектив)» в Дальневосточном центре АН СССР.
Является автором 130 научных трудов, включая 9 монографий и 1 учебное пособие. Ему принадлежат три региональных сводных картографических продукта (карт и глубинных разрезов) Хабаровского края[2].
Внёс большой вклад в развитие горной промышленности и геологоразведки Хабаровского края и Приамурья. Его имя стоит в одном ряду с такими геологами как Виктор Ярмолюк, Евгений Козловский, Вадим Туманов, Лев Красный.
Являлся одним из сопредседателей Горного совета в Дальневосточном федеральном округе, занимался делами представительства НП «Горнопромышленники России» в федеральном округе.
Был председателем Дальневосточного отделения Минералогического общества России, членом которого являлся с 1981 года.С 1990 года — академик РАЕН, с 1995 года — Международной академии минеральных ресурсов, с 2007 года — Академии горных наук. член Комитета «Твёрдая оболочка Земли» Тихоокеанской международной научной ассоциации[6].
Во многом благодаря его был создан геологический музей в Хабаровске, позволяющий показать красоту Хабаровского края, получить знания о природных богатствах Приамурья.
В 1964 году в составе группы учёных-геологов Дальневосточной геологической экспедиции ему присуждена Ленинская премия[7]. Награждён орденом Трудового Красного Знамени (дважды) и медалями. В 1995 году Академия естественных наук присвоила ему звание автора научного открытия им. П. Л. Капицы.
Комплексирование геологических и геохимических методов поисков оловорудных месторождений в горно-таёжных условиях: на примере Комсомольского рудного района: диссертация ... кандидата геолого-минералогических наук: 04.00.00. — Комсомольск-на-Амуре, 1970. — 206 с.: ил.
Критерии и методика комплексной оценки рудных районов / [Подгот. Ю. И. Бакулиным, В. Н. Гагаевым]. — М.: Недра, 1982. — 182 с.
В краю оловянных гор: рассказ о том, как совершаются геологические открытия, о рождении, становлении и славных делах орденоносной Комсомольской геологоразведочной экспедиции / редакторы-составители Ю. И. Бакулин и Г. М. Москаленко. — Хабаровск: Хабаровское книжное издательство, 1982. — 251, [3] с., [8] л. ил.: ил.; 17 см.
Золотоносные и оловоносные родные системы Дальнего Востока: (Типизация, прогнозирование, оценка перспектив): Автореф. дис. на соиск. учен. степ. д-ра геол.-минерал. наук: (04.00.14) / АН СССР, дальневост. центр, Дальневост. геол. ин-т. — Владивосток, 1987. — 43 с.
Силы тяготения: Записки геолога. — Хабаровск: Кн. изд-во, 1988. — 204,[2] с.: ил.; 17 см.
Металлогения Дальнего Востока России / Мин-во прир. ресурсов РФ, Дальневосточный науч.-исслед. ин-т минерал. сырья (ДВИМС); [Авторы: В. И. Сухов, Ю. И. Бакулин, Н. П. Лошак]. — Хабаровск: Б. и, 2000. — 217, [2] с.: схем., карт; 28 см. ISBN 5934040049.
Минерально-сырьевой потенциал Хабаровского края и его использование: Материалы научно-практической конференции, посвящённой 300-летию горно-геологической службы России и 150-летию геологических исследований в Приамурье, 3-4 ноября 2000 г., г. Хабаровск / Администр. Хабаровск. края. Департамент природн. ресурсов по Дальневост. региону, Дальневост. НИИ минерал. сырья; [Науч. ред. Ю. И. Бакулин]. —Хабаровск: [Издательство ДВИМСа], 2001. — 125 с., [4] л. ил., цв. фото, портр.: ил., схемы, карты; 20 см. ISBN 5-93404-009-X.
Карлинский тип золотого оруденения (закономерности размещения, генезис, геологические основы прогнозирования и оценки) / Ю. И. Бакулин, В. А. Буряк, А. Е. Пересторонин; Департамент природных ресурсов по дальневост. региону, Дальневост. науч.-исслед. ин-т минерал. сырья (ДВИМС). —Хабаровск: Издательство ДВИМСа, 2001. — 159 с.: ил.; 29 см. ISBN 5-93404-008-1.
Объективные закономерности развития: введение в проблему / Ю. И. Бакулин, И. В. Жукова. — Хабаровск: Изд-во ТОГУ, 2009. — 54 с.: ил.; 26 см.; ISBN 978-5-7389-0787-6
Особенности крупнообъемных месторождений золота = Some Special Features of Large-Scale Gold Deposits // Руды и металлы. — 2014. — № 2. — С. 20—24.
Развитие природы и общества в единой цепи / Ю. И. Бакулин, И. В. Жукова; М-во образования и науки Рос. Федерации, Тихоокеан. гос. ун-т. — Хабаровск: Изд-во ТОГУ, 2015. — 169, [1] с. — Библиогр.: с. 166—170. — ISBN 978-5-7389-1756-1.
Премии и награды
Ленинская премия (1964) — за открытие крупного оловорудного района у посёлка Солнечный[2]
Юдович Я. Э., Кетрис М. П. Российские геологи рассказывают о себе. Тексты с комментариями. Книга Третья. Советская геология. — Сыктывкар: Геопринт, 2014. — 336 с.
Мочаев В. А.Бакулин Юрий Ильич // Марийская биографическая энциклопедия / Авт.-сост. В. А. Мочаев. — 2-е изд. — Йошкар-Ола: Марийский биографический центр, 2017. — С. 42. — 606 с. — 1500 экз. — ISBN 978-5-905314-35-3.