Железнодорожное сообщение в Ахене открыто в 1 сентября 1841 года, когда Рейнской железнодорожной компанией введён в эксплуатацию участок Кёльн — Ахен. В дальнейшем железнодорожная ветка была продолжена до Антверпена, 15 октября 1843 года был открыт первый в мире международный участок железной дороги.
Первый вокзал Рейнской железной был построен в стиле классицизма и располагался на открытом поле за пределами ахенских городских стен. Вскоре пространство вокруг вокзала оказалось покрытым городской застройкой, что осложнило доступ к нему ввиду возросшей интенсивности уличного движения. Поэтому после национализации частных железнодорожных компаний и объединения их в единую сеть железных дорог Пруссии было принято решение о строительстве нового вокзала.
В 1901 году строительство нового здания началось. Здание нового вокзала в стиле модерна было торжественно открыто 21 декабря 1905 года. Крытый перрон включал в себя 4 платформы и 7 путей.
Во время многочисленных бомбардировок британской авиации в ходе Второй мировой войны здание вокзала почти не пострадало, но было взорвано при отступлении немецких войск осенью 1944 года. Ещё до окончания войны союзники восстановили движение поездов на участке Дюрен — Ойскирхен. К 1950 году весь вокзальный комплекс был восстановлен.
В послевоенные годы интенсивность железнодорожного движения в Ахене постоянно возрастала. Так в 1959 году годовой пассажиропоток составил 850 000 пассажиров, в 1961 — 1 000 000, в 1964 — 1,25 млн и в 1965 — 1,35 млн пассажиров.
Вплоть до середины 1960-х годов по станции Ахен осуществлялось только сообщение на тепловозной тяге, но в 1966 году в связи с электрификацией железнодорожного сообщения между Германией и Бельгией Deutsche Bahn AG выполнил работы по электрификации путей 6 — 9 по стандарту, совместимому с бельгийским национальным оператором железных дорог. NMBS/SNCB[1]. В ходе этой работы все пути и платформы подверглись значительной перестройке.
В 2000 году начался новый этап реконструкции ахенского вокзала. При этом перестраивались вестибюль, платформы и тоннель для доступа к ним. Открытие вокзала состоялось в августе 2006 года и было приурочено к проходящему в Ахене международному конному турниру.