Stanisław Wojciechowski a fost fiul lui Felix (1825-1881) și a celei de-a doua sa soție, Florentyna Vorhoff (cca. 1833-1910). Stanisław Wojciechowski a avut o soră, Mirowska Josepha și doi frați vitregi. El s-a căsătorit cu Maria Kiersnowska (1869-1959) și a avut o fiică Sofia, pictoriță, care s-a căsătorit cu Władysława Jana Grabskiego, scriitor (tatăl lui era Macieja Władysława Grabskiego și bunica Małgorzaty Kidawy-Błońskiej).[3] Președintele a avut, de asemenea, un fiu, Edmunda (1903–1941), avocat, care a murit în Auschwitz.[4]
