Muzeul Național de Natură și Știință (国立科学博物館,Kokuritsu Kagaku Hakubutsukan?) este situat în partea de nord-est a parcului Ueno. Deschis în 1871, a avut mai multe denumiri, incluzând Muzeul Ministerului Educației, Muzeul Tokyo, Muzeul de Științe din Tokyo, Muzeul Național de Știință din Japonia, și Muzeul Național de Natură și Știință începand din 2007[2]. A fost renovat în anii 1990 și 2000, și oferă o varietate largă de expoziții de istorie naturală și experiențe științifice interactive.
Muzeul are expoziții despre știința din perioada pre-Meiji din Japonia.