Ca urmare a morții împăratului Henric al VI-lea de Hohenstayufen din 1198, Berthold a fost unul dintre candidații la alegerea noului împărat. El și-a oferit proprii nepoți ca ostateci pe lângă arhiepiscopii electori de Köln și de Trier pentru a dobândi sprijinul acestora.[1] Cu toate acestea, atunci când a sesizat că o majoritate a ales pe candidatul HohenstaufenFilip de Suabia (anti-rege față de împăratul Otto al IV-lea de Braunschweig din Dinastia Welfilor), Berthold a renunțat la candidatura sa. În schimbul renunțării sale, Berthold a obținut concesii teritoriale în Germania de Sud și în nordul Elveției, consolidând posesiunile casei de Zähringen asupra Ortenau, Breisgau, Schaffhausen, Breisach și abația Tuturor Sfinților din Württemberg. În 1198, Filip de Suabia a plătit și el 3.000 de mărci de argint lui Berthold, pentru a-l determina să renunțe la pretențiile sale.
În același an, Berthold a zdrobit o revoltă a nobililor burgunzi, eveniment care a rămas inscripționat pe poarta Freiburgului.[2]
În 1200, Berthold a început activitatea de extindere a bisericii orașului-parohie Freiburg.[2]
Dinastiei Zähringenilor i s-a pus capăt odată cu moartea lui Berthold din 1218. Ca urmare, posesiunile familiei au fost împărțite între mai mulți nobili, iar Berna a devenit oraș imperial liber.