S-a născut în localitatea Étampes[1] (pe atunci în departamentul Seine-et-Oise). Tatăl său, Jean Gérard Geoffroy, a fost avocat în cadrul parlamentului francez.
Tânărul Étienne este dirijat către cariera ecleziastică și urmează cursurile colegiului Collège de Navarre unde, sub îndrumarea celebrului profesor Mathurin Jacques Brisson, studiază științele naturii.