A universidade surgiu do desmembramento dos polos de Quelimane e Beira da Universidade Pedagógica em meio à reforma no ensino superior moçambicano ocorrida no ano de 2019.[2]
Sua área de actuação primaz é nas províncias de Zambézia e Sofala.[2]
Etimologia
O nome da universidade, assim como da maioria das instituições de ensino superior públicas do país, faz referência a um rio, neste caso ao rio Licungo.
Em 2019 os polos de Quelimane e Beira são afetados com a reforma do ensino superior promovida pelo governo de Moçambique. A reforma propunha a descentralização da UP, de maneira que pudesse constituir novos centros universitários autônomos.[4] De tal proposta surgiu a UniLicungo, efetivada pelo decreto-lei n° 3/2019, de 15 de fevereiro de 2019, aprovado pelo Conselho de Ministros.[2]