O surgimento do Presbiterianismo no Acre deve-se ao trabalho da Junta de Missões Nacionais, da Igreja Presbiteriana do Brasil, com a ajuda do missionário Robert Henry Camenisch,[3] inicialmente em Rio Branco, no final do Século XX. Posteriormente várias cidades do interior do Estado foram alvos de projetos missionários e a fundação de escolas. Em 1994 foi organizado o Presbitério do Acre que se desdobrou em 2008 e outra vez em 2009, dando origem a outros dois presbitérios que formaram o Sínodo do Acre com dezenas de igrejas espalhadas por todo o Acre.[4][5][6]
A IPB tem um de seus 82 sínodos no Acre, o Sínodo Acre, que abrange as igrejas de todo o Estado.[10] Entre as instituições de ensino coordenada pela IPB e suas igrejas federadas no Acre estão o Colégio João Calvino em Rio Branco, e a Escola Presbiteriana de Cruzeiro do Sul.[4] A Junta de Missões Nacionais trabalha com missões no Acre nos municípios de Acrelândia, Assis Brasil, Tarauacá, Feijó e Epitaciolândia.[4][8][11]