Em janeiro de 2007 o diário belga Het Laatste Nieuws publicou uma série de reportagens nos que acusava a Lefevere de ter incitado aos seus corredores a doparse com substâncias como EPO e cocaína, bem como de ter recorrido à dopagem durante a sua época como ciclista. O diário assegurava que Lefevere tinha chegado a ter adição às anfetaminas, circunstância que teria sido o motivo real da sua retirada como ciclista. O meio baseou as suas acusações em oito depoimentos: seis pessoas anónimas do mundo ciclista, um médico italiano que trabalhou na Mapei e o ex ciclista da década de 1970Luc Cappelle.
Lefevere admitiu ter recorrido à dopagem quando era corredor, mas negou que durante a sua época como director tivesse incitado aos seus corredores a recorrer à dopagem ou que tivesse traficado com substâncias dopantes.[1] Por este motivo interpôs uma demanda contra os autores de ditas informações.
A 30 de outubro de 2009 o Tribunal Correccional da Bélgica condenou aos três jornalistas autores das reportagens a pagar uma indemnização a mais de 500.000 euros a Lefevere.[2]
