Nikolaus Messmer SJ (Qaraghandy, SSR do Cazaquistão, União Soviética, 19 de dezembro de 1954 - Bishkek, Quirguistão, 18 de julho de 2016) foi Bispo da Igreja Católica Romana e Administrador Apostólico no Quirguistão.[1][2]
Nikolaus Messmer vem de uma família alemã do Mar Negro de Speier, Beresan e Kandel, Kutschurhan, que foi deportada para o Cazaquistão sob a ditadura de Stalin.
Ingressou na ordem dos Jesuítas em 1975, emitiu a profissão em 1978 e foi ordenado sacerdote em 28 de maio de 1989. Depois do trabalho pastoral na paróquia “Arcanjo São Miguel” de Bishkek, única igreja católica da República do Quirguistão, foi reitor do seminário menor de Novosibirsk, na Rússia, de 1997 a 2001 e de 2004 a 2006. De 2001 a 2004 completou estudos de doutorado em espiritualidade na Pontifícia Universidade Gregoriana de Roma.
Um irmão de Nikolaus Messmer, Otto Messmer SJ (* 1961), foi assassinado em Moscou em 27 de outubro de 2008. Naquela época ele era superior dos jesuítas na Rússia. Seu irmão Hieronymus Messmer pertence à Província Alemã dos Jesuítas.
Nikolaus Messmer morreu pouco antes de uma operação em um hospital em Bishkek.[2]