Em um amistoso, o técnico do São Cristóvão gostou do então volante novante Michel e o chamou para o treinar no clube. Michel era o "10 e faixa" do time do São Cristóvão, onde se profissionalizou. Iniciou sua carreira nas categorias de base do tradicional clube carioca. Em 2008, ainda da categoria de juniores (sub-20), começou a fazer parte do elenco profissional, ficando no banco em alguns jogos.
Em 2009, já profissional, ganhou confiança e foi titular em alguns jogos durante a disputa da Segunda Divisão de 2009.
Após a conquista, o jogador já não fazia parte dos planos para o restante da temporada, então no dia 1º de julho de 2014 o atleta retornou por empréstimo ao Guarani de Palhoça para a sua segunda passagem pelo clube.
Camboriú
Completando o ano de contrato pelo clube catarinense, Michel se transferiu em 1º de julho de 2015 para outro clube do mesmo estado, o Camboriú, onde completou o ano de 2015.
Retorno ao Grêmio Novorizontino
Em 1º de janeiro de 2016, o atleta retornou de empréstimo ao Novorizontino, onde fez boas atuações pelo tigre e teve muitos clubes de olho nele, pelo esforço, entrega e entrosamento.
Como seu contrato de empréstimo ao Atlético Goianiense se encerrou em 30 de novembro de 2016, o jogador nem chegou a se reapresentar ao Novorizontino e já foi novamente emprestado, desta vez para o Grêmio, em contrato a valer de 1º de janeiro de 2017.[7] No Grêmio, iniciou o ano alternando partidas entre a reserva e a titularidade, mas depois da lesão de Maicon, virou titular absoluto na equipe e foi um dos destaques do Grêmio no Campeonato Brasileiro de 2017, tendo inclusive vencido a Bola de Prata.[8] Porém, no fim de setembro Michel se lesionou e perdeu a vaga de titular na reta final da Libertadores para Jailson.[9]
Empréstimos
Michel foi emprestado em 2020 ao Fortaleza, por um ano.[10] Em agosto, ele teve seu contrato rescindido e retornou ao Grêmio para a recuperação de uma cirurgia no joelho esquerdo.[11] Ele ficou no clube até maio do ano seguinte, quando foi emprestado ao Vasco da Gama até dezembro.[12]
Retorno ao clube
Em 2022, o volante retornou ao Grêmio para tratar uma lesão.[13] Ele foi relacionado para algumas partidas, mas não entrou em campo.[14]
Operário
No final de julho de 2022, depois de rescindir contrato com o Grêmio, Michel foi contratado pelo Operário, de Ponta Grossa.[15]