Em 02 de dezembro de 1848 Fernando abdicou como Imperador da Áustria, mas manteve sua posição imperial. Maria Ana estava intitulada imperatriz Maria Ana. Eles viviam na aposentadoria juntos, passando os invernos na Castelo de Praga e os verões em Reichstadt (agora Zákupy) ou em Ploschkowitz (agora Ploskovice).
Maria Ana morreu em Praga. Ela está enterrado ao lado de seu marido no túmulo número 63, na Cripta Imperial de Viena.
Títulos e honras
Estilo imperial e real de tratamento de Maria Ana da Áustria
2 de dezembro de 1848 - 4 de maio de 1884:Sua Majestade Imperial e Real Apostólica, a Imperatriz Maria Ana da Áustria, Rainha da Hungria, Croácia e Boêmia, etc.