O primeiro representante do poder executivo e prefeito do município foi Hermínio Jorge de Castro, logo após a emancipação do município.[3][9] Nos últimos anos, o cargo foi ocupado por Marcos Fernando Moraes, o Marquinhos, do Partido Democrático Trabalhista (PDT), eleito em 2008 com 54,73% dos votos válidos (5.974 votos),[10] mas foi afastado do cargo. Dirigiu a prefeitura interinamente a partir de 3 de junho de 2011 o presidente da Câmara Municipal, Anderson Pedroni Gorza, então no Partido Comunista do Brasil (PCdoB),[11][12] até a recondução de Marquinhos em 3 de agosto de 2011.[13] Marquinhos foi novamente afastado em 1º de setembro de 2011[14][15][16][17][18] e Anderson voltou a assumir a prefeitura em 5 de setembro.[19] Anderson também foi afastado, assumindo em seu lugar no dia 7 de março de 2012 o presidente em exercício da Câmara, Claydson Pimentel Rodrigues, do Partido Socialista Brasileiro (PSB).[20][21] O cargo foi ocupado entre 1º de janeiro de 2013 e 31 de dezembro de 2016 por Maria Dulce Rudio Soares, do Partido do Movimento Democrático Brasileiro (PMDB), eleita em 2012 com 37,43% dos votos válidos (3.959 votos).[22] Pelo Partido Social Democrático, Anderson Pedroni Gorza foi o candidato a prefeito mais votado em 2016, com 8.564 votos, mas sua candidatura foi indeferida pela Justiça Eleitoral. Desde 1º de janeiro de 2017, o município é governado pelo prefeito interino Eleazar Ferreira Lopes, do Partido Comunista do Brasil (PCdoB), licenciado da presidência da Câmara.[23] Após eleição suplementar para prefeito em 1º de outubro de 2017, o novo prefeito Pretinho Nunes (PDT) foi empossado no dia 27 do mesmo mês.[24]
O município de Fundão se rege por uma lei orgânica.[8] É sede de comarca de Fundão.[27] De acordo com o Tribunal Regional Eleitoral do Espírito Santo (TRE-ES), o município possuía, em maio de 2017, 14.125 eleitores.[28]
↑ESPÍRITO SANTO (estado). Lei 1.383/1923: Transfere séde de municipio e eleva povoação á categoria de villa. Governo do Espirito Santo: Victoria, 1923
↑«Lei N. 1.383». Victoria. Diario da Manhã. 1 páginas. 6 de julho de 1923
↑ ab«História do Município». Câmara Municipal de Fundão. Consultado em 13 de maio de 2010. Arquivado do original em 1 de agosto de 2013Erro de citação: Código <ref> inválido; o nome "historiaCamara" é definido mais de uma vez com conteúdos diferentes
↑ ab«História do município». Câmara Municipal de Fundão. Consultado em 10 de outubro de 2011. Arquivado do original em 1 de agosto de 2013
↑ANNUARIO do Espírito Santo e Norte do Brasil. Supplemento da Revista Chanaan. Vitória: [s.n.] 1938. pp. 109 a 112
↑ abc«Lei Orgânica»(PDF). Câmara Municipal de Fundão. Consultado em 8 de agosto de 2012. Arquivado do original(PDF) em 15 de abril de 2010
↑ANNUARIO do Espírito Santo e Norte do Brasil. Supplemento da Revista Chanaan. "Sr. Herminio Jorge de Castro, conseguiu transferir definitivamente, a séde para a Villa de Fundão, no governo do Dr. Florentino Avidos". Vitória: [s.n.] 1938. pp. 109 a 112
↑«Comarcas». Corregedoria Geral da Justiça do Espírito Santo. Consultado em 8 de agosto de 2012
↑«Eleitorado atual». Tribunal Regional Eleitoral do Espírito Santo. Consultado em 20 de junho de 2017
↑ESPÍRITO SANTO (estado)titulo=Orçamentos Municipais para o Exercício de 1941 (1940). Vitória: Departamento das MunicipalidadesEm falta ou vazio |título= (ajuda)
↑ESPÍRITO SANTO (estado)titulo=Orçamentos Municipais para o Exercício de 1943 (1942). Vitória: Departamento das MunicipalidadesEm falta ou vazio |título= (ajuda)