Regressado a Braga, passou a trabalhar na Secretaria Episcopal, onde se manteve de Junho de 1971 a Setembro de 1973, tendo durante este período colaborado na pastoral da Igreja dos Terceiros, em Braga. Em 1 de Outubro de 1973 foi nomeado Reitor da Igreja dos Congregados e Capelão da Irmandade de Nossa Senhora das Dores e Santa Ana, erecta na mesma Igreja.
No Seminário Conciliar de Braga, (depois Instituto Superior de Teologia e agora Faculdade de Teologia-Braga) leccionou as cadeiras de introdução aos Estudos Históricos, História das Religiões e História da Igreja. Foi responsável pelo Secretariado Arquidiocesano das Vocações e Presidente do Instituto de História e Arte Sacra. Presidiu ao Secretariado Geral do 40.º Sínodo Diocesano e coordenou o Secretariado Diocesano de Pastoral. É Presidente do Conselho de Administração do Instituto Diocesano de Apoio ao Clero (IDAC). É Presidente da Assembleia Geral da Associação "Dar as Mãos". Na Conferência Episcopal Portuguesa presidiu à Comissão Episcopal da Doutrina da Fé e pertenceu à Comissão Episcopal da Educação Cristã. Entre 4 de Abril de 2005 e 3 de Maio de 2011 desempenhou funções como presidente da Conferência Episcopal Portuguesa.