Era filho do capitão-mor Inácio Marcondes do Amaral e de Ana Joaquina de Oliveira Marcondes. Ainda jovem, deixou a família em Pindamonhangaba para dedicar-se aos estudos em Taubaté, iniciando sua educação literária, que foi concluída em São Paulo. Decidiu seguir sua vocação, tornando-se sacerdote, e satisfazendo assim o desejo de seus pais.[1]
Era irmão do coronel Manuel Marcondes de Oliveira Melo, que comandou a Guarda de Honra de Dom Pedro I quando este proclamou a Independência do Brasil. Na mansão da família Marcondes em Pindamonhangaba esteve hospedado o próprio Imperador em 21 e 22 de agosto de 1822, quando de sua histórica viagem entre o Rio de Janeiro e São Paulo, que culminou com a proclamação da Independência. Duas décadas depois, em 16 de julho de 1842, o barão Luís Alves de Lima e Silva, futuro Duque de Caxias também se hospedaria na mansão dos Marcondes quando estava em missão militar, nomeado pelo governo imperial para combater a Revolução Liberal de 1842.[3]