O IHMT tem como missão a realização de ensino e investigação nas áreas da medicina tropical, das ciências biomédicas e da saúde internacional, a prestação de serviços clínicos, laboratoriais e de saúde pública à comunidade, a contribuição para a resolução de problemas de saúde global, especialmente nas regiões tropicais, a cooperação internacional e a divulgação do conhecimento científico.
O atual IHMT foi criado a 24 de abril de 1902, por carta de lei do ReiD. Carlos I, como Escola de Medicina Tropical. Até então, e desde 1887, o ensino da medicina tropical era realizado na Escola Naval, destinando-se sobretudo aos médicos do Ministério da Marinha e Ultramar. O objetivo da nova escola era o do ensino e da melhoria do conhecimento científico dos problemas de saúde ligados aos meios tropical e intertropical, especialmente no Ultramar Português.
Em 1935, a Escola de Medicina Tropical foi transformada no Instituto de Medicina Tropical (IMT).
Em 1958, o IMT instalou-se na atual sede, um moderno edifício construído junto ao Hospital do Ultramar (atual Hospital Egas Moniz), o qual - como hospital especializado em doenças tropicais - lhe servia de apoio.
Através do Decreto-Lei n.º 47 102 de 16 de julho de 1966, o IMT deu lugar à nova Escola Nacional de Saúde Pública e de Medicina Tropical (ENSPMT), que se ocupava também da vertente da saúde pública.
Em 1972, através do Decreto-Lei n.º 372/72 de 2 de outubro, a ENSPMT divide-se em duas instituições, dando origem ao atual Instituto de Higiene e Medicina Tropical e à Escola Nacional de Saúde Pública.
O IHMT manteve-se na dependência do Ministério do Ultramar até à extinção deste. Em 1980, foi integrado na Universidade Nova de Lisboa.
Ensino
No IHMT é realizado ensino superior nas áreas ligadas à medicina tropical, ciências biomédicas e saúde internacional, especialmente de pós-graduação. Nomeadamente, são ministrados mestrados em saúde tropical, ciências biomédicas, saúde e desenvolvimento, parasitologia e microbiologia e doutoramentos em medicina tropical, ciências biomédicas e saúde internacional. Além disso, também são ministrados cursos de curta duração e de pós-graduação em estrito senso.
