A sua construção, bem como a do Convento de Nossa Senhora da Esperança a que pertence, foi iniciada antes de 1535 pelo seu fundador, o capitão donatário Rui Gonçalves da Câmara (o 2.º de nome), falecido em 20 de outubro daquele ano. Depois de suspensas por algum tempo, as obras prosseguiram por iniciativa da sua viúva, D. Filipa Coutinho.[1]
A decoração do teto da igreja, da primitiva talha da capela-mor e dos altares laterais, foi realizada em 1668 pelo pintor micaelense Manuel Pinheiro Moreira, irmão da Ordem Terceira de São Francisco de Ponta Delgada. Presentemente, toda a igreja encontra-se valorizada com recentes trabalhos artísticos que a tornam um dos mais belos templos da ilha.[2]
COSTA, Francisco Carreiro da. "1. Igreja de Nossa Senhora da Esperança - Ponta Delgada". in História das Igrejas e Ermidas dos Açores. Ponta Delgada (Açores): jornal Açores, 17 abr 1955- 17 out 1956.