Logo foi eleito para a Royal Society e em 1687 tornou-se membro do Royal College of Physicians. Seguindo o Duque de Albemarle, fez uma viagem à Jamaica entre 1685 e 1686, onde coletou cerca de 800 novas espécies de plantas que deram origem a um herbário particular e em 1696 publicou um elaborado catálogo em Latim. Assim começou a colecionar plantas, livros, manuscritos e curiosidades adquiridas durante suas viagens, que formaram a base do Museu Britânico.
Alguns anos depois de sua morte, em 1759, o Parlamento do Reino Unido aprovou a compra da coleção de obras pertencente a esse brilhante irlandês, dando origem assim ao Museu Britânico, incluindo 150 peças originárias do Egito e 50 mil volumes, além de 3.560 manuscritos.