Filho do pastor Johann Georg Wedel, estudou medicina a partir dos 16 anos na Universidade de Jena, onde foi aluno de Johann Theodor Schenck e Werner Rolfinck. Teve de desistir de um estudo subsequente no exterior devido à morte de seu pai, permanecendo em Jena. Praticou em Gorzów Wielkopolski e Sulechów, até que em 1667 foi chamado para ser médico da cidade de Gotha. Após obter o doutorado em 1672 em Jena, lá assumiu a cátedra de medicina.
A partir de 1685 foi real e imperial médico saxônico. Foi seguidor dos ensinamentos químicos de Franciscus Sylvius .
Seus filhos Ernst Heinrich Wedel (1 de agosto de 1671 — 13 de abril de 1709) e Johann Adolf Wedel (1675 — 1747) foram também médicos.
