Em seu ministério como sexto bispo da Diocese de Bonfim, Dom Francisco implantou no Ginásio Diocesano uma das etapas de formação inicial ao sacerdócio; ordenou dezesseis padres e dois diáconos; implantou a Pastoral Hospitalar; fortaleceu o movimento Encontro de Casais em Cristo; promoveu a reforma da Casa Episcopal e a iniciação da reforma geral da Catedral Diocesana. Também tomou parte no Conselho Nacional do Encontro de Casais com Cristo.[2]