A parte das margens não modificada pelo homem é povoada por mangais e encontra-se submetida a enorme pressão pelas referidas actividades económicas. No entanto, o estuário é ainda utilizado por muitos pescadores, uma vez que ali abunda camarão e outros mariscos.
Toponímia
O termo estuario de Espíritu Santo faz referência à antiga denominação do Rio Matola, que era conhecido em português como Río Espírito Santo.[2]