Republika Południowego Peru ogłosiła niepodległość 17 marca 1836, zaś 28 października 1836 połączono trzy państwa w Konfederację Peruwiańsko-Boliwijską. W wyniku wojny narzuconej przez Chile i Argentynę Północne i Południowe Peru ogłosiły 25 sierpnia 1839 ponowne zjednoczenie i wystąpienie z konfederacji, co oznaczało jej rozpad.
Władze
Zgodnie z konstytucją z 1837 Południowe Peru było w ramach konfederacji jedną z trzech samorządnych republik. Na czele konfederacji stał protektor, zaś republikom przewodzili prezydenci.