Klub został założony w 1891 roku jako Panachaikos Gymnastikos Syllogos. W 1894 roku w mieście Patras utworzono inny klub Gymnastiki Eteria Patron, a w 1923 roku doszło do fuzji obu zespołów, dzięki czemu powstał nowy o nazwie Panachaiki Gymnastiki Enosi. Największymi sukcesami Panachaiki były występy w pierwszej lidze greckiej. W 1973 roku drużyna zajęła w niej 4. miejsce, dzięki czemu w sezonie 1973/1974 wystąpiła w Pucharze UEFA, jednak odpadła w 2. rundzie po spotkaniach z holenderskimFC Twente. W 2003 roku Panachaiki spadło z Alpha Ethniki, a w 2004 roku z Beta Ethniki (odpowiednik 2. ligi). W 2004 roku miała miejsce fuzja Panachaiki z Patraikosem.
Q – runda eliminacyjna, 1/16, 1/8, 1/4, 1/2 – odpowiednia faza rozgrywek, Grupa – runda grupowa, 1r gr – pierwsza runda grupowa, 2r gr – druga runda grupowa, F – finał, R – runda, PO – play-off
k. – rzuty karne, los. – losowanie, Dogr. – dogrywka, w. – zasada bramek strzelonych na wyjeździe
↑Polska transkrypcja alfabetu greckiego według zaleceń Głównego Urzędu Geodezji i Kartografii. Dostępna również transkrypcja według normy ISO 843 – Panachaïkí Gymnastikí Énosī
