Komisarz Brytyjskiego Terytorium Oceanu Indyjskiego reprezentuje władzę brytyjską na tym terytorium. Jest on mianowany przez monarchę na wniosek Foreign and Commonwealth Office. Komisarz nie rezyduje na wyspach, gdzie nie ma stałych mieszkańców, lecz w Londynie.
Komisarz zarządzą terytorium w imieniu rządu, uchwala odpowiednie akty legislacyjne. Jest odpowiedzialny za kontakt z wojskami amerykańskimi i brytyjskimi z bazy wojskowej Diego Garcia.
Asystentem komisarza jest administrator, który także rezyduje w Londynie. Przedstawicielem komisarza na wyspach jest najstarszy rangą oficer brytyjski w bazie wojskowej Diego Garcia.