W latach 1976–1985 był wykładowcą teologii moralnej na Oscott College, a następnie został sekretarzem w Papieskiej Rady ds. Popierania Jedności Chrześcijan w Rzymie, gdzie pracował do 1993.
Po powrocie do Anglii w 1993 został proboszczem w Sparkhill, gdzie pracował do 1998 roku. W 1998 został rektorem seminarium w Oscott[2].
6 listopada 2003 McDonald otrzymał nominację na arcybiskupa Southwark. Objął rządy w diecezji 8 grudnia 2003.[1] W dniu 4 grudnia 2009 arcybiskup McDonald zrezygnował ze stanowiska ze względu na stan zdrowia[3].
