Mistrzowie każdej z grup uzyskały awans na poziom centralny – do II ligi. Po 5 lub po 3 ostatnie drużyny (zależnie od planowanej liczby drużyn w sezonie 2017/2018) spadły na poziom wojewódzki – do odpowiedniej terytorialnie grupy IV ligi.
Drużyny, które wycofały się z rozgrywek po rozegraniu mniej niż 50% spotkań, były automatycznie relegowane o dwa szczeble ligowe niżej (do klasy okręgowej) i przesunięte na koniec tabeli, a osiągnięte przez nie rezultaty zostały anulowane. Drużyny, które wycofały się z rozgrywek po rozegraniu 50% lub więcej spotkań, również były automatycznie relegowane o dwa szczeble ligowe niżej i przesunięte na koniec tabeli, a za nierozegrane mecze przyznawane były walkowery 3:0 dla zespołów przeciwnych. Wykluczenie z rozgrywek groziło także za nieprzystąpienie z własnej winy do trzech meczów.
Pelikan Niechanowo, wicemistrz III ligi kujawsko-pomorsko-wielkopolskiej zrezygnował z gry w III lidze po zakończeniu sezonu 2015/2016, w związku z czym dodatkowo utrzymała się Elana Toruń.
Vineta Wolin przegrała swoje mecze barażowe o awans do II ligi z Odrą Opole, mistrzem III ligi opolsko-śląskiej.
Rol.Ko Konojady, mistrz IV ligi kujawsko-pomorskiej zrezygnował z awansu do III ligi, dzięki czemu awansował wicemistrz Chemik Bydgoszcz.
Górnik Konin, mistrz IV ligi wielkopolskiej południowej wygrał swoje mecze barażowe o awans do III ligi z Wartą Międzychód, mistrzem IV ligi wielkopolskiej północnej.
Źródło: 90minut.pl Oznaczenia: (M) – tytuł mistrzowski, (A) – awans, (S) – spadek. Zasady ustalania kolejności:1. liczba zdobytych punktów w całym cyklu rozgrywek; 2. liczba punktów zdobyta w meczach bezpośrednich; 3. różnica bramek w meczach bezpośrednich; 4. różnica bramek w meczach bezpośrednich – bramki zdobyte na wyjeździe liczone podwójnie; 5. różnica bramek w całym cyklu rozgrywek; 6. liczba zdobytych bramek w całym cyklu rozgrywek. Bezpośrednio: stosowane, gdy dwie lub więcej drużyn mają identyczny dorobek punktowy. Objaśnienia: 1KS Chwaszczyno po zakończeniu sezonu przekazał licencję i miejsce w III lidze w sezonie 2017/2018 KP Starogard Gdański, wicemistrzowi IV ligi pomorskiej i będzie występował w gdańskiej klasie B.
Źródło: 90minut Objaśnienia: 1Drużyna gospodarzy jest wymieniona po lewej stronie tabeli. Kolory: zielony – zwycięstwo gospodarzy, żółty – remis, różowy – zwycięstwo gości.